这个概念引用于回族医学后有所侧重与创新。元气自然生化的整个过程，只能通过不断地运动才能实现。而运动变化最大的和最突出的特征，集中体现于“动”与“静”两个方面。回族医学认为：混沌元气开始生化，则“一动一不动，遂于其中有两分之象”。其“静”多动少者，谓之“阴”；“动”多静少者，谓之“阳”。也就是说，将这两种相反的运动方式及其相互作用，视为阴与阳本质性的内涵，同时把它们作为元气的广化，万物极其重要的连续性的运动过程。
当阴阳概念开始被引入、消化和进行更大的抽象之际，阿拉伯医学与中医学的诸多说法，曾不断地被吸收。在回族先贤不少有关著述中，对此也有反映。如认为冷为阴、热为阳：阴阳“始分”，黑者为阴，白者为阳；阴阳“终分”，阴敛于内，阳发于外；“重浊者下降，属阴也”，“轻清者上升，属阳也”；阴中寓有“真水”，阳中寓有“真火”等。但回回医学更重视“阴”与“阳”、“动”与“静”的辩证关系。提出在元气“化而为两的过程中，其初分也，二者互杂，不甚相离。及其后也，阳积于一处，而驳疆乎有向表之机；阴积于一处，而稳稳乎有向里之势。”虽然如此，“阳中含有真阴，阴中含有真阳，而非阳一于阳，阴一于阴也。”并认为宇宙问并无“纯阴”、“纯阳”以及“全阴”、“全阳”的存在。
回族医学更加重视阴阳的和谐统一，“阴阳互合，而生男女”、“一粟之生，九天之功”。没有阴阳的统一，事物就不能发生、发展与变化，生命过程也成为无源之水，无本之木。所以，回族医学主张积极创造维护人体阴阳“动态”平衡的条件，进而达到“小世界”与“大世界”的和谐统一的目的。